2016年，10x Genomics公司推出ChromiumTM系統(tǒng)，這是一套分子條形碼和分析系統(tǒng)，由儀器、試劑盒和信息學(xué)軟件組成，能夠?qū)覫llumina測序儀。
中國蠑螈(Hynobius chinensis)是中國瀕危的兩棲蠑螈，因其研究古生物學(xué)進(jìn)化史和減少種群規(guī)模的價值而備受關(guān)注。盡管對Hynobius chinensis基因組越來越感興趣，但該物種的基因組資源仍然非常有限。應(yīng)該產(chǎn)生一個綜合的Hynobius chinensis轉(zhuǎn)錄組，它將為基因組注釋，候選基因鑒定和分子標(biāo)記開發(fā)提供資源以補充它。
中國浙江海洋大學(xué)的研究人員通過Illumina測序進(jìn)行了Hynobius chinensis轉(zhuǎn)錄組的從頭組裝?？偣搏@得148,510個非冗余unigenes，平均長度約為580bp。總共60,388(40.66%)unigenes在至少一個數(shù)據(jù)庫中顯示同源匹配，并且33,537(22.58%)unigenes在所有四個數(shù)據(jù)庫中注釋?？偣灿?1,553個unigenes通過BLAST2GO搜索被分類為62個子類別，并且19,468個轉(zhuǎn)錄物被分配到140個KEGG途徑。鑒定了大量涉及免疫系統(tǒng)，局部適應(yīng)，繁殖和性別決定的unigenes，以及31,982個簡單序列重復(fù)(SSR)和460,923個推定的單核苷酸多態(tài)性(SNP)。
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